Η ιστορία του συλλόγου
Δύο ήταν τα παλιά ιστορικά ποδοσφαιρικά σωματεία της πόλης. "Ο Αχιλλεύς" (1923) αντιπροσώπευε την άρχουσα τάξη και η ΑΕ Τρικάλων (1947) υποστηριζόταν κυρίως από τις λαϊκότερες τάξεις . Ήταν η εποχή που η ταξική πάλη είχε την έκφρασή της και στο ποδόσφαιρο, όπως άλλωστε συμβαίνει σε πολλά μέρη του κόσμου. Η ενοποίησή τους όμως δεν προήλθε από μια συνειδητή απόφαση συνεργασίας. Την αγωνιστική περίοδο 1962-63 που μετείχαν και οι δύο στη Β΄ Εθνική, κατέλαβαν την 2η και την 4η θέση! Καμιά από τις δύο ομάδες δεν ανέβηκε στα σαλόνια του πρωταθλήματος. Ήταν μια τραγωδία που ανάγκασε όμως τις διοικήσεις των συλλόγων κατόπιν έντονων πιέσεων της τοπικής φίλαθλης κοινωνίας και των ίδιων των παικτών, να ξεπεράσουν τις αντιρρήσεις του παρελθόντος και να προχωρήσουν στη συγχώνευση. Στις 10 Ιουλίου 1963 ιδρύθηκε ο ΑΟ Τρίκαλα με φανέλα κόκκινη-μπλε και έμβλημα δύο ενωμένους κύκλους ανάλογων χρωματισμών. Τη νέα ομάδα στελέχωσαν οι καλύτεροι ποδοσφαιριστές των προηγούμενων, ενώ οι υπόλοιποι εντάχθηκαν στη Δήμητρα Τρικάλων που δημιουργήθηκε για το σκοπό αυτό.
Άνοδος και πτώση του συλλόγου
Τα αποτελέσματα της ενοποίησης ήταν θριαμβευτικά. Άνοδος κατά το πρώτο κιόλας έτος της ύπαρξής του, ο ΑΟ Τρίκαλα αγωνίστηκε στην Α' Εθνική για 6 συνολικά περιόδους μέσα σε 10 χρόνια. Ακολούθως σταθεροποιήθηκε επί ένα ίδιο διάστημα στη Β' κατηγορία, πριν αρχίσει να εναλλάσσεται μεταξύ αυτής και της Γ'. Νέα ανοδική πορεία από το 1994, οδήγησε στον τίτλο του πρωταθλητή της Β' Εθνικής (για 4η φορά) το 1999 και την επιστροφή στα "μεγάλα σαλόνια" έπειτα από μία 26ετία.
Μετά αρχίζει η παρακμή του συλλόγου, λόγω λαθών της διοίκησης και οικονομικών προβλημάτων. Αποτέλεσμα της σχεδόν διετούς αδρανοποίησης του ΑΟ Τρίκαλα, ήταν να διατρέξει σοβαρό κίνδυνο διαγραφής του από το μητρώο συλλόγων της Ελληνικής Ποδοσφαιρικής Ομοσπονδίας (ΕΠΟ), εάν επί τρίτη συνεχή περίοδο δεν παρουσίαζε αγωνιστική δράση. Τότε όμως κινητοποιήθηκαν οι οργανωμένοι οπαδοί οι περίφημοι Σακαφλιάδες, και παλαίμαχοι παίκτες και απλοί φίλαθλοι της πόλης.
Την αγωνιστική περίοδο 2014-15 ο ΑΟΤ συμμετείχε στη Γ' κατηγορία, ερασιτεχνική (από το καλοκαίρι του 2013 κατόπιν της αναδιάρθρωσης των ποδοσφαιρικών κατηγοριών) και κατάφερε να κερδίσει το πρωτάθλημα και μαζί με αυτό την άνοδό του στη Football League.
Στις 21 Μαρτίου 2015 κατέκτησε το κύπελλο Γ' εθνικής Ερασιτεχνικής 2014-15 (κατά τη δεύτερη διεξαγωγή του θεσμού), νικώντας 3-2 τον Εθνικό Πειραιώς στον τελικό του δημοτικού σταδίου Άμφισσας.
Οι πιστοί «Σακαφλιάδες»
Ιστορικά, ο πρώτος οργανωμένος σύνδεσμος οπαδών του υπήρξε ο Σύνδεσμος Φιλάθλων Α.Ο. Τρίκαλα “Θύρα 4”. Πλέον, έχει μετονομαστεί σε Σύνδεσμος Φιλάθλων - “Σακαφλιάδες” με δυναμική παρουσία και δράση σε αρκετά επίπεδα.